作為全球增長速度最快的公司之一，亞馬遜在全球范圍內擁有頂尖的供應鏈業務。但無論效率有多高、規模有多大，總是有許多問題或風險涉及。

首先，雖然Prime對消費者來說是非常好的，但對賣家來說卻不是那么友好。FBA賣家的產品有資格獲得免費送貨服務；但是，賣家必須支付與其商品有關的運輸費用，而且他們不能夠選擇哪些產品提供免費送貨。由于大多數賣家的大部分產品都是免費送貨，這樣一來，平臺收取的配送費就會侵蝕到賣家利潤。

其次是亞馬遜將所有商品記錄到系統中需要大量時間，這會在某種程度上導致包裹交付時間的延遲。這種延遲會對客戶滿意度產生直接的負面影響，并導致負面評論和星級評價。

除此之外，亞馬遜供應鏈的風險還包括你的產品有可能在每天處理的無數產品中丟失。在產品丟失的情況下，亞馬遜會補償賣家；但是，補償的金額是由亞馬遜決定的，而不管你的產品售價為多少或者值多少錢。其結果是，賣家遭受損失。

而在有些情況下，從亞馬遜供應鏈分析中并不能準確預測出來所有商品的需求情況，這也會影響消費者的滿意度。因此，在做出為當季購物高峰做準備的備貨決策時，它并不總是可靠。賣家可以利用利潤儀表板等工具來獲得準確的銷售信息，并進行有效的庫存管理。

在繁忙的購物期間，訂單的交付往往以物流方面的問題而告終。這可能導致大量不滿意的客戶，他們沒有在計劃的時間內收到他們訂購的產品。但是，這也促使亞馬遜獨立處理這項工作，使最后一英里的交付問題越來越好。